Anwendungsbezogene Grundlagenforschung mit Pilzen

Anwendungsbezogene Grundlagenforschung mit Pilzen von Haneklaus,  Birgitt, Kück,  Ulrich
Am Beispiel des Penicillin-Antibiotikaproduzenten Penicillium chrysogenum wird in diesem Artikel die Verknüpfung von Grundlagenforschung und angewandter Forschung aufgezeigt. Bei diesem industriell genutzten Hyphenpilz konnten vor kurzem zum ersten Mal Sexualprozesse beobachtet werden, die von genetischen Faktoren abhängig sind. Dabei wurde entdeckt, dass diese genetischen Faktoren auch die Antibiotikaproduktion wesentlich beeinflussen. Beispielhaft wird somit die Grundlagenforschung mit der anwendungsbezogenen Fragestellung verknüpft.
Aktualisiert: 2023-02-06
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Untersuchung zur Aktivität des Transposons Restless in dem heterologen Wirt Neurospora crassa

Untersuchung zur Aktivität des Transposons Restless in dem heterologen Wirt Neurospora crassa von Windhofer,  Frank
In der vorliegenden Arbeit wurde erstmals die Aktivität des Transposons Restless in dem Hyphenpilz Neurospora crassa analysiert. Dabei wurden Untersuchungen zum Nachweis der Restless-Exzision und zum Einfluß wirtsspezifischer Faktoren auf die Aktivität dieses Transposons durchgeführt. Zusammengefaßt wurden folgende Ergebnisse erhalten: 1. Es wurden verschiedene Vektorkonstrukte für die Transformation von N. crassa hergestellt. Diese Vektoren enthielten unterschiedliche Restless-Kopien. Mit Hilfe PCR-vermittelter in vitro Mutagenese wurden Veränderungen innerhalb der Restless-Sequenz vorgenommen, um eine Optimierung der Restless-Aktivität in dem heterologen Wirt zu erzielen. 2. Das Transposon Restless wurde erfolgreich in den Hyphenpilz N. crassa transformiert. Integriert das Transposon in vielen Kopien in das Genom von N. crassa, so wird es in vegetativen Hyphen methyliert. Diese Methylierung beruht auf einem hohen TpA-Dinukleotid-Verhältnis in bestimmten Abschnitten der Restless-Sequenz. Wurde das Transposon jedoch mit einer einzelnen Kopie über homologe Rekombination in der Nähe des his-3 Lokus integriert, so wurde es nicht methyliert. Transformanten mit einer einzelnen integrierten Restless-Kopie waren die Grundlage für die weiteren Untersuchungen zur Aktivität des Restless-Transposons in N. crassa. 3. Das Restless-Transkript wird in N. crassa gespleißt. Der Mechanismus des alternativen Spleißens von Restless wurde durch Veränderung der Intron-Spleißsequenzen näher untersucht. Die ursprüngliche Restless Intron-Sequenz wird in N. crassa nicht optimal erkannt und somit nicht effizient gespleißt. Eine Veränderung der 5'-Spleiß-Sequenz zu einer Konsensus-Sequenz für Hyphenpilze optimierte die Spleiß-Effizienz des Restless-Transkriptes. Die Modifikation an der 5'-Intron-Sequenz hatte jedoch keinen Einfluß auf das alternative Spleißen des Restless-Elementes. Ein optimiertes alternatives Spleißen konnte durch Modifikation der 3'-Spleiß-Sequenz erzielt werden. Der Spleiß-Mechansimus konnte vermutlich nur dann zwischen den beiden Kodonen unterscheiden, wenn an einer der zwei 3'-Spleiß-Sequenzen eine Modifikation vorlag. 4. Das Transposon Restless ist ein aktives Klasse II Element im heterologen Wirt N. crassa. Es wurden Exzisionsereignisse mittels PCR-Analysen nachgewiesen. Restless exzisiert sowohl korrekt als auch inkorrekt. Die korrekte Restless-Exzision hinterließ keine "footprints", so daß die ursprüngliche "Wildtyp-Situation" wiederhergestellt wurde. Bei der inkorrekten Exzision blieben terminale DNA-Bereiche des Transposons nach der Exzision zurück. N. crassa-Isolate, bei denen diese Exzisionen nachgewiesen wurden, konnten durch zwei unabhängige Selektionssysteme erzielt werden, eine "Vorwärts-Selektion" und eine dominante Selektion. Beide Selektionssysteme ergaben Isolate, in denen identische Exzisionsprodukte ermittelt wurden. 5. In dem heterologen Wirt Neurospora crassa aber auch im homologen System Tolypocladium inflatum konnten erstmals Derivate des Transposons Restless mit internen Deletionen ermittelt werden. Diese Derivate sind vermutlich das Ergebnis einer inkorrekten Exzision von Restless, bei der interne Bereiche unterschiedlicher Größe zwischen repetitiven DNA-Sequenzen verloren gegangen sind. Der Aufbau und die Entstehung dieser (Rst-Elemente weisen deutliche Homologien zu den Ds-Elementen aus dem Mais auf. 6. Durch den Nachweis veränderter Hybridisierungsmuster bei verschiedenen N. crassa Isolaten konnten erstmals in einem heterologen Organismus putative Transpositionsereignisse für das Restless-Element nachgewiesen werden. Ausgehend von Transformanten mit einer einzelnen Restless-Kopie traten zusätzliche Banden bei der Southern-Hybridisierung auf. Das Restless-Element transponiert somit vermutlich bevorzugt während der Replikation. Dieser Mechanismus der Transposition wurde bereits für das Activator-Elemente im Mais nachgewiesen. In dieser Arbeit wird erstmals die Aktivität des Transposons Restless in dem Hyphenpilz Neurospora crassa beschrieben. Die erhaltenen Ergebnisse zeigen, daß die Transposition von Restless ein sehr komplexer Vorgang ist, der von sehr unterschiedlichen Faktoren beeinflußt wird. Neben einer korrekten Restless-Sequenz muß die Methylierung repetitiver Sequenzen, die Effektivität des alternativen Spleißens und der Zeitpunkt der Restless-Transposition in dem heterologen System N. crassa berücksichtigt werden. Bei einer Optimierung der Restless-Aktivität unter Berücksichtigung dieser Faktoren können die Grundlagen geschaffen werden, das Transposon Restless als molekulares Werkzeug für die Etablierung eines Transposon-Mutagenese-Systems zu verwenden.
Aktualisiert: 2022-11-21
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Heterologe Genexpression in dem Cephalosporin C produzierenden Hyphenpilz Acremonium chrysogenum

Heterologe Genexpression in dem Cephalosporin C produzierenden Hyphenpilz Acremonium chrysogenum von Radzio,  Renate
In der vorliegenden Arbeit werden Analysen zur heterologen Genexpression in dem biotechnologisch relevanten Hyphenpilz Acremonium chrysogenum vorgestellt. Zur Kontrolle der heterologen Genexpression wurde der homologe pcbC Promotor eingesetzt, der Teil eines Biosynthesegens des ß-Lactam-Antibiotikums Cephalosporin C ist. Der Promotor wurde einer funktionellen Analyse unterzogen und anschließend zur Entwicklung eines Systems zur Expression heterologer Gene in A. chrysogenum eingesetzt, das anhand eines eukaryontischen Modellgens etabliert wurde.
Aktualisiert: 2022-06-24
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Verbreitung und AKtivität des Transposons Restless in biotechnologisch relevanten Hyphenpilzen

Verbreitung und AKtivität des Transposons Restless in biotechnologisch relevanten Hyphenpilzen von Jacobsen,  Sabine
Ziel der hier vorliegenden Arbeit war es, die Verbreitung des Transposons Restless in einer Gruppe verwandter Hyphenpilze zu untersuchen und die Eignung des Elements zur Transposon-Mutagenese zu überprüfen. Um die Verwandtschaftsbeziehungen der Stämme untereinander zu analysieren, wurde zusätzlich eine molekulare Charakterisierung dieser Pilzstämme durchgeführt.
Aktualisiert: 2022-07-27
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Glukoseregulation der Cephalosporin C-Biosynthese im Hyphenpilz Acremonium chrysogenum

Glukoseregulation der Cephalosporin C-Biosynthese im Hyphenpilz Acremonium chrysogenum von Jekosch,  Kerstin
In der vorliegenden Arbeit wurde erstmals die Glukoseregulation der pharmazeutisch relevanten Cephalosporin C-Biosynthese in verschiedenen Stammen des Imperfekten Hyphenpilzes A. chrysogenum auf molekularer Ebene analysiert. Hierbei stand die Beeinflussung der Expression der Biosynthesegene pcbC, cefEF und cefG im Mittelpunkt des Interesses. Zusätzlich wurde der Transkriptionsfaktor CREA aus A. chrysogenum isoliert und seine Beteiligung an der Glukoseregulation untersucht. Zusammenfassend wurden folgende Ergebnisse erhalten: 1) Northern-Analysen der Transkriptmengen des pcbC-Gens zeigten, daß dieses Gen einer stammspezifischen transkripttonalen Regulation durch Glukose unterliegt, die im Wildtyp ATCC 14553, nicht aber in den Semiproduzenten A3/2 und Act zu beobachten ist. Durch Herstellung eines spezifischen Antiserums und Western-Analysen konnte gezeigt werden, daß keine zusätzliche Regulation auf transtattonaler Ebene vorliegt. 2) Durch Northern-Analysen der Transkriptmengen des ceEF-Gens konnte nachgewiesen werden, daß dieses Gen in allen drei untersuchten Stämmen transkripttonal durch Glukose reprimiert ist. Untersuchungen der Transkriptstabilitäten in Abhängigkeit von Glukose zeigten, daß ein posttranskriptionaler Effekt nicht vorhanden ist. Durch Western-Analysen konnte eine zusätzliche Glukoseregulation auf transtattonaler Ebene ausgeschlossen werden. 3) Beim cefG-Gen war keine glukosebedingte Regulation auf transkripttonaler Ebene zu beobachten. Nach Herstellung eines spezifischen Antiserums und Western-Analysen zeigte sich, daß auch auf transtattonaler Ebene kein Einfluß vorhanden ist. Die Untersuchungen der produzierten Mengen an ß-Lactam-Antibiotika ließen ebenfalls keinen Einfluß auf das Genprodukt von cefG auf posttranstattonaler Ebene vermuten. Das cefG-Gen stellt somit das bisher einzige Gen innerhalb des Cephalosporin C-Biosyntheseweges dar, daß keine Regulation durch Glukose aufweist. 4) In vielen Hyphenpilzen wird eine glukoseabhängige transkripttonale Repression durch Transkriptionsfaktoren der CREA/CRE1-Familie vermittelt. Innerhalb der vorliegenden Arbeit konnte erstmals das creA-Gen aus A. chrysogenum aus einer Lambda-Genbank isoliert werden Nur Genprodukt CREA ist in allen funktionalen Domänen konserviert und weist große Homologien zu CRE1 aus Trichoderma reesei auf. Zudem liegt eine glukoseabhängige positive Regulation von creA in A. chrysogenum vor, die eine Autoregulation sowie eine bisher unbekannte Aktivatorfunktion vermuten läßt. 5) Durch das Einbringen zusätzlicher Kopien des creA-Gens in das Genom von A. chrysogenum A3/2 konnte eine transkripttonale Glukoseregulation des vorher in diesem Stamm dereguliertenpcbC-Gens erreicht werden, die mit der im Wildtyp ATCC 14553 beobachteten übereinstimmte. Gleichzeitig wurde die transkripttonale Repression des ceEF-Gens verstärkt. Hieraus läßt sich schließen, daß CREA an der Glukoseregulation der beiden Gene beteiligt ist. Ein entsprechendes Modell der CREA-Wirkung wird vorgestellt. Glukose ist den Ergebnissen zufolge ein wichtiger Faktor in der negativen Regulation der Cephalosporin C-Biosynthese in A. chrysogenum. Mit dem Glukoserepressor CREA konnte erstmals ein Transkriptionsfaktor aus A. chrysogenum identifiziert werden, der an einem regulativen Prozeß in diesem Hyphenpilz beteiligt ist. Langfristig kann die Aufklärung nährstoffabhängiger und stammspezifischer Regulationsmechanismen zur Optimierung der Anzucht in industriellen Prozessen sowie zur gezielten Stammverbesserung auf gentechnischer Ebene dienen.
Aktualisiert: 2022-08-01
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Funktionsanalyse und molekulare Charakterisierung der bifunktionalen Expandase /Hydroxylase aus dem Hyphenpilz Acremonium chrysogenum

Funktionsanalyse und molekulare Charakterisierung der bifunktionalen Expandase /Hydroxylase aus dem Hyphenpilz Acremonium chrysogenum von Pfeil,  Michael
In der vorliegenden Arbeit wird die molekulare Charakterisierung der bifunktionalen Expandase/Hydroxylase aus dem Hyphenpilz Acremonium chrysogenum vorgestellt. Dieser Hyphenpilz synthetisiert das ß-Lactam-Antibiotikum Cephalosporin C. In der Biosynthese von Cephalosporin C wird Penicillin N durch die Expandase-Reaktion in Desacetoxycephalosporin C und durch die Hydroxylase-Reaktion in Desacetylcephalosporin C umgesetzt. Mit Hilfe eines Strukturmodells wurde die Frage geklärt, ob die beiden Reaktionen in einem gemeinsamen oder zwei getrennten Aktivitätszentren katalysiert werden.
Aktualisiert: 2015-10-07
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